1963年，在大内科中组建神经内科组，设病床20张，未单设门诊。同年开展了一侧颈动脉脑血管造影、气脑造影、经小脑延髓池穿刺造影及椎管造影。 1973年内科开设了神经内科专业门诊。 1979年7月神经内科组从内科划出，与神经外科组一起组建神经科，神经内科设病床15张，医师5名。神经内、外组共值门诊及急诊。 1980年添置脑电图仪、肌电图仪，成立了神经电生理室。 1980年开始应用皮质激素治疗重症肌无力，取得较好的疗效。 1981年始对部分脊蛛网膜炎粘连的病人应用鞘内氧气注入疗法，在国内开展属于较早者。 1982年始对脑出血破入脑室和蛛网膜下腔出血病人开展侧脑室引流术和脑脊液置换术。 1983-1984年,对22例散发性脑炎患者进行脑脊液病毒分离的病因研究,有2例分离出肠道病毒(已通过北京病毒研究所鉴定)。同年开展了对脑血管病患者的舌侧、球结膜微循环观察。 1986年医师增至8名，设病床20张。 1992年神经内科从神经科中独立，有医师12人，护士14人，病床30张，神经内科门诊独立值班。 1992年开展了黄连素抗血小板聚集的基础与临床研究，成果在国内居领先地位。获济宁市科技进步二等奖。同年开展对神经脱髓鞘疾病（包括格林巴利综合征、多发性硬化等）进行血浆治疗，效果明显。 1993年病床增至33张。 1994年底医院干部病房解散，四病区并入神经内科，神经内科分为普通病房和干部病房（简称干四）两病区，经济独立核算。普通病房设床位33张，有医师14 人，护士15人；干四病区设床位22张，有医师3人，护士8人。 1995年引进经颅多普勒超声，开展脑血流状况监测。 1996年引进He-Ne激光治疗仪，对脑血管病人及脑血管病合并前列腺症状者进行治疗，取得较好的疗效。 1998年医护工作人员42人，组建脑脊液细胞学研究室对神经系统的感染、肿瘤转移诊断和治疗观察均有很大帮助。同年成立了临床流行病学研究室，开展了省、市项目“缺血性脑血管病的复发及其危险因素的研究”、“糖尿病周围神经病的危险因素的初步研究”、“银杏叶提取物金纳多治疗脑梗死的研究”等，成果在国内均居领先地位，分别获省（三等奖）、市（二、三等奖）科技进步奖。是年与B超室合作，开展颈动脉硬化与脑血管病及相关因素的研究工作。 1998年引进颅脑超声治疗仪，开展超声治疗脑血病偏瘫。 2001年与市中心血站合作，率先开展临床应用血浆置换疗法治疗中枢及周围神经的脱髓鞘病及肌病，取得了十分明显的效果。 2002年成立心理咨询门诊，配备相应的心理测查软件系统，开展心理、智商测试及心理障碍治疗。并开通心理热线1606120。 2003年引进世界最先进的神经肌电仪（丹迪EYPOINT）。 2003年引进40万元的康复设备，成立神经康复中心，有专职的康复人员，引进先进的康复理念。 2004年病房床位扩至2个病区78张床位。 2004年成立华瑞痴呆研究所，加大对认知功能障碍的研究。2007年病房扩至3个病区130张床，神经康复中心扩至300平方的门诊康复大厅及病房康复两部分，除开展原常规开展的ＰＴ，ＯＴ，语言治疗外，又新开展了吞咽康复，肉毒毒素治疗肌张力增高及神经心理康复。２００９年开展神经肌肉病理及卒中预警预防工作，建立了中华预防医学会济宁卒中预防预警培训基地。